More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5080 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  84.26 
 
 
409 aa  644  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  87.12 
 
 
394 aa  689  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  89.14 
 
 
394 aa  719  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  89.14 
 
 
394 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  89.14 
 
 
394 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  88.64 
 
 
427 aa  716  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  85.86 
 
 
394 aa  681  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  88.89 
 
 
427 aa  718  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  88.64 
 
 
394 aa  716  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  89.14 
 
 
394 aa  721  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  83.25 
 
 
397 aa  636  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.97473e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  100 
 
 
396 aa  793  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  82.74 
 
 
397 aa  635  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  84.85 
 
 
394 aa  676  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  83.25 
 
 
397 aa  636  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  82.99 
 
 
397 aa  634  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  89.14 
 
 
427 aa  718  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  82.49 
 
 
397 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  78.54 
 
 
394 aa  630  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  80.05 
 
 
394 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  78.79 
 
 
394 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  82.49 
 
 
397 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  80.05 
 
 
394 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  78.28 
 
 
394 aa  624  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  76.77 
 
 
394 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  76.01 
 
 
395 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  76.77 
 
 
394 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  77.53 
 
 
395 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  75.76 
 
 
394 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  75.51 
 
 
394 aa  575  1e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  75.51 
 
 
394 aa  575  1e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  67.77 
 
 
396 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  71.97 
 
 
393 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  67.09 
 
 
395 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  65.82 
 
 
398 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  69.04 
 
 
396 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.89 
 
 
396 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  66.08 
 
 
395 aa  507  1e-142  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  64.72 
 
 
394 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  62.76 
 
 
421 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  4.71879e-08  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  65.06 
 
 
395 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  65.99 
 
 
395 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  62.34 
 
 
398 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  61.58 
 
 
392 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  62.09 
 
 
394 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  61.83 
 
 
394 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  64.89 
 
 
397 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  62.6 
 
 
392 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  61.83 
 
 
394 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
393 aa  468  1e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  62.09 
 
 
394 aa  471  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  62.09 
 
 
389 aa  471  1e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  60.76 
 
 
393 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  60.61 
 
 
394 aa  461  1e-128  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  58.67 
 
 
393 aa  459  1e-128  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.03 
 
 
393 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  61.83 
 
 
400 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  59.03 
 
 
391 aa  454  1e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  57.51 
 
 
391 aa  454  1e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  61.07 
 
 
389 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  57.36 
 
 
395 aa  440  1e-122  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  55.81 
 
 
394 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  55.05 
 
 
394 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  55.19 
 
 
393 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  55.3 
 
 
393 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  54.94 
 
 
393 aa  415  1e-115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
402 aa  408  1e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 
392 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  54.31 
 
 
395 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  52.91 
 
 
393 aa  400  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  54.31 
 
 
393 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
393 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
392 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
392 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 
392 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  1.52049e-05 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
393 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  52.76 
 
 
392 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
394 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
392 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
394 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
393 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.51 
 
 
392 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
392 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 
392 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  52.88 
 
 
395 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
393 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>