More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4954 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  89.83 
 
 
405 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  90.07 
 
 
405 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  88.64 
 
 
405 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  90.07 
 
 
405 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  88.4 
 
 
405 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  80.2 
 
 
404 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  80.4 
 
 
404 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  82.61 
 
 
388 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  72.16 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  72.16 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  71.89 
 
 
400 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  65.34 
 
 
395 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  65.23 
 
 
398 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  65.23 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  61.89 
 
 
400 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  60.5 
 
 
399 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  59.35 
 
 
401 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50 
 
 
393 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  59.6 
 
 
399 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  60 
 
 
399 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.37 
 
 
399 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  62.47 
 
 
402 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  48.83 
 
 
398 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  50.41 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  47.96 
 
 
396 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  43.69 
 
 
389 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  43.69 
 
 
389 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
402 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  45.07 
 
 
406 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  43.83 
 
 
407 aa  292  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 
402 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  50.13 
 
 
408 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  45.6 
 
 
413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  44.12 
 
 
405 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.36 
 
 
399 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.1 
 
 
399 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.12 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  41.4 
 
 
416 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.37 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.36 
 
 
399 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.31 
 
 
385 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.8 
 
 
406 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.8 
 
 
406 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.8 
 
 
403 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.44 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  49.39 
 
 
409 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.37 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.92 
 
 
394 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
394 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
394 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.92 
 
 
394 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
387 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
413 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  39.95 
 
 
383 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.41 
 
 
394 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  42.03 
 
 
394 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
394 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.69 
 
 
405 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  41.32 
 
 
425 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  42.47 
 
 
394 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
406 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
399 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.77 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.01 
 
 
394 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.4 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.76 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.76 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  41.51 
 
 
391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.76 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.76 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.76 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  41.53 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.76 
 
 
394 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.04 
 
 
389 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.23 
 
 
433 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  40.26 
 
 
403 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 
399 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  39.25 
 
 
395 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
391 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.27 
 
 
399 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
403 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.02 
 
 
426 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  36.73 
 
 
401 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  39.45 
 
 
431 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.73 
 
 
422 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  39.01 
 
 
427 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
413 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>