More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4733 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  94.58 
 
 
277 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  94.58 
 
 
277 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  94.22 
 
 
277 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  92.06 
 
 
277 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  92.11 
 
 
279 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  92.42 
 
 
277 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  84.59 
 
 
278 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  83.45 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  81.23 
 
 
275 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  81.29 
 
 
275 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  81.59 
 
 
275 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  72.32 
 
 
285 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  62.65 
 
 
262 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  74.79 
 
 
289 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  63.95 
 
 
263 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  60.7 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  68.5 
 
 
273 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  70.69 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  56.98 
 
 
262 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  68.91 
 
 
274 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  62.18 
 
 
262 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  55.42 
 
 
256 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  62.86 
 
 
262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  52.34 
 
 
277 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  50 
 
 
262 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  46.59 
 
 
258 aa  244  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  51.36 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  49.61 
 
 
273 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  51.19 
 
 
267 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  44.44 
 
 
280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  47.47 
 
 
271 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  48.43 
 
 
274 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  46.46 
 
 
269 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.24 
 
 
281 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  46.06 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  48.03 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.95 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.94 
 
 
258 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  48.94 
 
 
258 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  42.13 
 
 
254 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.31 
 
 
282 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
263 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  39.59 
 
 
256 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  33.83 
 
 
262 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 
261 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  35.1 
 
 
255 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  35.1 
 
 
255 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 
255 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 
260 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  36.1 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  35.66 
 
 
263 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  38.36 
 
 
261 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 
276 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
269 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  33.2 
 
 
256 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  31.84 
 
 
251 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
282 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  36.04 
 
 
271 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 
282 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.04 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.57 
 
 
622 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  31.71 
 
 
239 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.11 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  28.85 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.48 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.12 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  30 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
199 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.39 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.89 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>