64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4540 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  100 
 
 		 151 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  86.3 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  85.03 
 
 		 150 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  85.03 
 
 		 150 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  75.34 
 
 		 148 aa  214  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  74.66 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  75 
 
 		 148 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  75.34 
 
 		 148 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  63.24 
 
 		 216 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  61.83 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  54.41 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  51.64 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  38.97 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  48.15 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  50 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  50 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  40.68 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  33.09 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  44.95 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  43.48 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  34.4 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  48.96 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  34.4 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  34.29 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  34.43 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  28.35 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.09 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.04 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  44.12 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  26.09 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  34.29 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  30.39 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  30.39 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  30.39 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.3 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  33.68 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.83 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.57 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.19 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  28.3 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  25.4 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  26.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  27.83 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  25.4 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  32.12 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.51 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  26.42 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1142  hypothetical protein  27.48 
 
 		 250 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  32.28 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  34.44 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  25.44 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  31.4 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  31.4 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>