More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4500 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0875  porin  94.82 
 
 
386 aa  733  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  94.82 
 
 
386 aa  733  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  93.78 
 
 
386 aa  725  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  100 
 
 
386 aa  768  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  95.08 
 
 
386 aa  735  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  94.04 
 
 
386 aa  728  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  90.93 
 
 
386 aa  684  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  76.52 
 
 
388 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  67.3 
 
 
523 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  67.4 
 
 
430 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  67.4 
 
 
384 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  67.4 
 
 
411 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  67.4 
 
 
384 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  67.4 
 
 
384 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  67.4 
 
 
384 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  67.4 
 
 
430 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  64.27 
 
 
394 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  66.21 
 
 
385 aa  469  1e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  64.95 
 
 
385 aa  470  1e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  64.13 
 
 
385 aa  465  1e-130  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  64.85 
 
 
385 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  64.85 
 
 
385 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  64.58 
 
 
385 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  62.91 
 
 
386 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.69 
 
 
387 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  60.62 
 
 
386 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  60.45 
 
 
393 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  59.7 
 
 
393 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  61.04 
 
 
386 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  60 
 
 
386 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  55.73 
 
 
390 aa  417  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  61.37 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  61.48 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  61.48 
 
 
386 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  58.09 
 
 
404 aa  407  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  54.36 
 
 
390 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  54.36 
 
 
390 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  56.49 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  55.61 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  55.47 
 
 
430 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  55.61 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  56.79 
 
 
390 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  55.36 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  55.36 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  55.36 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  56.25 
 
 
390 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  55.36 
 
 
390 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  56.25 
 
 
390 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  56.25 
 
 
390 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  54.01 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  54.01 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  54.01 
 
 
376 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  53.49 
 
 
376 aa  357  3e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50 
 
 
389 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  46.43 
 
 
421 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  46.43 
 
 
421 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.68 
 
 
397 aa  303  4e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.95 
 
 
445 aa  302  7e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.11 
 
 
397 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.67 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.67 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.67 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.67 
 
 
399 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.67 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.86 
 
 
397 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.53 
 
 
391 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.11 
 
 
397 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.36 
 
 
397 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.78 
 
 
436 aa  285  6e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.08 
 
 
389 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.27 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.27 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.27 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.27 
 
 
436 aa  284  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.27 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.27 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.84 
 
 
385 aa  283  3e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.84 
 
 
385 aa  283  4e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.02 
 
 
386 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.65 
 
 
383 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.65 
 
 
383 aa  274  1e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.65 
 
 
383 aa  274  1e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.89 
 
 
383 aa  272  8e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.71 
 
 
389 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.74 
 
 
378 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.71 
 
 
389 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.61 
 
 
389 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.90839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  42.82 
 
 
400 aa  266  6e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.93 
 
 
391 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  45.33 
 
 
381 aa  262  9e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  42.58 
 
 
400 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.46 
 
 
395 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.99 
 
 
402 aa  254  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.96 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  43.85 
 
 
403 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  40.98 
 
 
400 aa  246  7e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.21 
 
 
380 aa  245  1e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  41.54 
 
 
393 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  41.94 
 
 
395 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  37.3 
 
 
422 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>