More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4474 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
326 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  95.4 
 
 
326 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  95.09 
 
 
326 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  95.09 
 
 
326 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  92.94 
 
 
326 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  92.94 
 
 
326 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  91.1 
 
 
326 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.41 
 
 
324 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  54.04 
 
 
325 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  54.66 
 
 
325 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  58.64 
 
 
324 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.72 
 
 
324 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.41 
 
 
324 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.04 
 
 
325 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
325 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.87 
 
 
328 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
325 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.41 
 
 
361 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.56 
 
 
325 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  53.87 
 
 
325 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 
325 aa  344  8.999999999999999e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
326 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  56.33 
 
 
334 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
325 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  57.41 
 
 
324 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  55.25 
 
 
324 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 
325 aa  328  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.63 
 
 
324 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.62 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
324 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 
324 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.85 
 
 
324 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
324 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 
331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 
324 aa  298  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  54.6 
 
 
325 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
326 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
324 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.91 
 
 
324 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.76 
 
 
326 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.14 
 
 
326 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.7 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
324 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  48.15 
 
 
323 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
337 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
324 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
340 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
319 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.63 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 
327 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
319 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 
319 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 
326 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 
324 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  43.12 
 
 
331 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.72 
 
 
326 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  44.44 
 
 
325 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  44.88 
 
 
319 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
319 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
324 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
325 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  44.38 
 
 
333 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
324 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.81 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 
329 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.23 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
335 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 
324 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
331 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 
325 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
329 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.15 
 
 
327 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.77 
 
 
326 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
332 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.23 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
322 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
324 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1046  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.54 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0321902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
335 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.3 
 
 
321 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 
322 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.31 
 
 
329 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>