More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4469 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
404 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  67.71 
 
 
401 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.71 
 
 
399 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  67.71 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  67.71 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  63.06 
 
 
381 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  66.48 
 
 
400 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  66.01 
 
 
401 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  62.27 
 
 
381 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  65.44 
 
 
399 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  59.75 
 
 
402 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  64.39 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  65.06 
 
 
380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.49 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  64.77 
 
 
380 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.49 
 
 
380 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  64.49 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  64.49 
 
 
376 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  64.49 
 
 
380 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.49 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  64.2 
 
 
380 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.49 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  64.2 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.49 
 
 
380 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  64.2 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  65.77 
 
 
336 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  63.92 
 
 
380 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  66.29 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  63.64 
 
 
380 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  64.2 
 
 
384 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  63.07 
 
 
384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.42 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  62.4 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  61.42 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  61.26 
 
 
382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  61.74 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.42 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.42 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  64.27 
 
 
381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.42 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
384 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  61.86 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  61.86 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  59.38 
 
 
369 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  61.71 
 
 
380 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  59.38 
 
 
384 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  54.05 
 
 
381 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  53.64 
 
 
460 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  52.23 
 
 
371 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.46 
 
 
382 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  49.46 
 
 
382 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.42 
 
 
379 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  50.14 
 
 
379 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.14 
 
 
379 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  50.14 
 
 
379 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.14 
 
 
375 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  49.86 
 
 
379 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  49.86 
 
 
379 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  49.86 
 
 
379 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  49.05 
 
 
382 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.86 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  49.18 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  49.04 
 
 
380 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  48.2 
 
 
379 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  48.02 
 
 
398 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  48.2 
 
 
379 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  48.75 
 
 
379 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  50.85 
 
 
376 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  49.16 
 
 
377 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  50.85 
 
 
376 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 
379 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  47.54 
 
 
376 aa  346  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 
401 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 
379 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  50.85 
 
 
599 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 
379 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  48.99 
 
 
376 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  47.17 
 
 
375 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  48.85 
 
 
375 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  46.98 
 
 
381 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  48.41 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  46.86 
 
 
383 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  48.6 
 
 
383 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  49.73 
 
 
380 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  47.93 
 
 
380 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  48.14 
 
 
376 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  48.82 
 
 
383 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  48.9 
 
 
380 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 
383 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  47.7 
 
 
377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  48.13 
 
 
376 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  46.72 
 
 
381 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  46.44 
 
 
376 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 
373 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  46.07 
 
 
382 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>