More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4384 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  93.54 
 
 		 356 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  100 
 
 		 356 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  94.38 
 
 		 356 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  94.38 
 
 		 356 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  93.88 
 
 		 327 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  38.82 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  37.71 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  35.61 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.33 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  34.17 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.42 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.85 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.7 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  34.45 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.91 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  32.6 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  33.72 
 
 		 394 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  35.26 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  35.55 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.41 
 
 		 354 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  33.33 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  34.4 
 
 		 395 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  33.81 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.24 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.98 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.7 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  33.97 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  33.97 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  32.76 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  32.76 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  31.62 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  33.24 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.07 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  32.65 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  29.79 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  32.08 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  32.61 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.79 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.79 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.08 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  34.34 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.51 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.08 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.24 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.85 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.85 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  30.59 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.01 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.8 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.77 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  33.63 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  32.55 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  33.78 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.47 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.83 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.47 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  35.01 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  32.6 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.42 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  32.11 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  31.84 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.9 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  31.52 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.32 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.23 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  31.1 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  31.52 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  31.48 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  31.48 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  31.48 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  31.48 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.6 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  31.19 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  31.48 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.21 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  32.03 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  31.07 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.99 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.9 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.77 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.44 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  31.48 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  31.47 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  31.48 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  30.35 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  31.48 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  30.81 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.77 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  30.81 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.4 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  32.61 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.97 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  32.91 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  31.9 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.35 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  32.45 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.4 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  31.86 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.14 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  29.3 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>