More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4373 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  100 
 
 
351 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  42.34 
 
 
363 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  41.78 
 
 
362 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  41.06 
 
 
362 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  41.18 
 
 
362 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  40.45 
 
 
362 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  44.06 
 
 
366 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  40.45 
 
 
362 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  42.34 
 
 
363 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  42.62 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  43.77 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  42.62 
 
 
363 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  42.62 
 
 
363 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  43.48 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  43.64 
 
 
363 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  41.27 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  35.79 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  35.52 
 
 
383 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  34.78 
 
 
389 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  34.92 
 
 
386 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  34.92 
 
 
386 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.56 
 
 
384 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  34.92 
 
 
386 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  34.92 
 
 
386 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  34.92 
 
 
386 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  38.27 
 
 
388 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  35.52 
 
 
383 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.69 
 
 
384 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  34.92 
 
 
436 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  35.52 
 
 
383 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  34.76 
 
 
436 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.31 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  34.1 
 
 
389 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.75 
 
 
389 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  34.92 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  34.67 
 
 
386 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  34.38 
 
 
379 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  36.25 
 
 
386 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  34.38 
 
 
379 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  34.92 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  33.33 
 
 
379 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  33.33 
 
 
379 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  33.33 
 
 
379 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.81 
 
 
387 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  33.75 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.58 
 
 
385 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  33.5 
 
 
393 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.22 
 
 
375 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  33.59 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.58 
 
 
385 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  36.21 
 
 
363 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.48 
 
 
386 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  32.82 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  31.82 
 
 
380 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  32.48 
 
 
380 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  32.74 
 
 
383 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  32.48 
 
 
380 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  32.74 
 
 
383 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  32.74 
 
 
383 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  37.27 
 
 
422 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  32.74 
 
 
383 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  32.74 
 
 
383 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  33.92 
 
 
381 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  34.77 
 
 
372 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.7 
 
 
375 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  31.68 
 
 
379 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  32.74 
 
 
481 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.7 
 
 
375 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  33.5 
 
 
384 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  34.79 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  34.79 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  34.79 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.17 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  34.94 
 
 
384 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  32.06 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  30.35 
 
 
396 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  35.04 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  33.25 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 
387 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  37 
 
 
382 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.91 
 
 
387 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  37 
 
 
382 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.84 
 
 
381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  37 
 
 
424 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  34.01 
 
 
387 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.01 
 
 
380 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  33.24 
 
 
375 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  33.17 
 
 
389 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.09 
 
 
381 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  33.52 
 
 
369 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  32.89 
 
 
379 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  35.13 
 
 
387 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  32.53 
 
 
370 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.19 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.19 
 
 
385 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>