More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4344 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1209  LacI family transcription regulator  97.36 
 
 		 341 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2073  LacI family transcription regulator  95.01 
 
 		 341 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4344  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 341 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1117  LacI family transcription regulator  95.01 
 
 		 341 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.972514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0754  LacI family transcription regulator  96.77 
 
 		 341 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1118  LacI family transcription regulator  94.72 
 
 		 341 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1235  LacI family transcription regulator  96.77 
 
 		 341 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3070  LacI family transcription regulator  77.41 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2828  LacI family transcription regulator  77.11 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1216  LacI family transcription regulator  77.41 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0651  LacI family transcription regulator  77.41 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1413  LacI family transcriptional regulator  77.41 
 
 		 341 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1420  LacI family transcriptional regulator  77.41 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0502  LacI family transcription regulator  77.41 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1469  LacI family transcription regulator  73.35 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.12048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1500  LacI family transcription regulator  71.98 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2647  transcriptional regulator, LacI family  73.05 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  57.48 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  55.06 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1460  transcriptional regulator, LacI family  54.46 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0141269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4839  putative LacI family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0301104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1266  transcriptional regulator, LacI family  44.68 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2153  alanine racemase  45.92 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419726  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  41.95 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0485  transcriptional repressor, LacI family  40.73 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4696  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.59 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3125  LacI family transcription regulator  39.93 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1774  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.472871  normal  0.0293451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.31 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.89 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.89 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  30.89 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.89 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.92 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.92 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.64 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 346 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.79 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.87 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  33.67 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.81 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.69 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.56 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.56 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.56 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.56 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.19 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.64 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.25 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3311  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.472161  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.16 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.4 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.25 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.25 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  31.12 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.19 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.79 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  28.93 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.89 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  34.14 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.64 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  35.39 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.14 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.15 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.79 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>