More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4328 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  93.49 
 
 
308 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  93.81 
 
 
308 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  93.81 
 
 
308 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  90.88 
 
 
308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  90.88 
 
 
308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  77.99 
 
 
310 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  86.32 
 
 
308 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  81.17 
 
 
310 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  81.23 
 
 
310 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  80.67 
 
 
302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  80.84 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  80.84 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  80.84 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  80.84 
 
 
310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.06 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  67.1 
 
 
322 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  70.67 
 
 
324 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  57.93 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.72 
 
 
310 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.38 
 
 
310 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  52.4 
 
 
310 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  48.21 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  52.43 
 
 
295 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  52.2 
 
 
310 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  48.77 
 
 
298 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  46.67 
 
 
335 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.49 
 
 
324 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  43.43 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  47.9 
 
 
312 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.22 
 
 
312 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  45.95 
 
 
298 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  46.73 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  47.04 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  38.21 
 
 
300 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  42.18 
 
 
295 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  43.96 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  39.8 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  41.95 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40.67 
 
 
297 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  40.21 
 
 
303 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 
290 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  39.78 
 
 
310 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  35.62 
 
 
298 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  34.03 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
299 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  38.14 
 
 
302 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  38.21 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 
283 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  38.73 
 
 
291 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  38.38 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  35.37 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  42.56 
 
 
303 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.29 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.87 
 
 
319 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  32.7 
 
 
302 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  36.54 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  37.92 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.67 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  49.15 
 
 
119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  34.25 
 
 
311 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.22 
 
 
290 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  32.35 
 
 
314 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.48 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.31 
 
 
306 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 
307 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.25 
 
 
324 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.12 
 
 
326 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.9 
 
 
324 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  32.71 
 
 
305 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  34.41 
 
 
316 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 
301 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  33.44 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.88 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.13 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  29.55 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 
304 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  34.5 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.78 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.8 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
313 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.84 
 
 
364 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  29.67 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.23 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  32.99 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.03 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>