292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4318 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  97.69 
 
 
347 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
347 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  97.69 
 
 
347 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  95.97 
 
 
347 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  96.83 
 
 
347 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  97.69 
 
 
347 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  94.24 
 
 
347 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  87.11 
 
 
347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  85.85 
 
 
351 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  86.12 
 
 
351 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  85.85 
 
 
351 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  85.85 
 
 
351 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  85.85 
 
 
351 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  85.85 
 
 
351 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  85.85 
 
 
351 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  79.31 
 
 
354 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  70.35 
 
 
348 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  70.35 
 
 
349 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  65.87 
 
 
338 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  65.87 
 
 
380 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  63.99 
 
 
338 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  66.87 
 
 
362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  62.32 
 
 
345 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  62.14 
 
 
345 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  65.63 
 
 
341 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  64.85 
 
 
341 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  64.24 
 
 
341 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  63.72 
 
 
337 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  61.42 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  58.51 
 
 
336 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 
338 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  55.73 
 
 
338 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  55.11 
 
 
337 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 
346 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  47.97 
 
 
337 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  46.8 
 
 
337 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  48.66 
 
 
337 aa  330  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  50.3 
 
 
338 aa  329  4e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  47.66 
 
 
335 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  45.77 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  45.07 
 
 
336 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  47.26 
 
 
335 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 
337 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  46.73 
 
 
335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 
335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  48.14 
 
 
335 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.25 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  45.13 
 
 
339 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 
336 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  44.81 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  44.38 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  45.65 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  45.34 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 
335 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 
335 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  42.68 
 
 
337 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  45.31 
 
 
345 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 
347 aa  252  7e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  41.43 
 
 
350 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
345 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
349 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
347 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.43 
 
 
350 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  37.71 
 
 
346 aa  249  6e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 
352 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 
351 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 
337 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  41.69 
 
 
365 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 
355 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  41.69 
 
 
365 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.23 
 
 
335 aa  245  8e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  43.81 
 
 
347 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.88 
 
 
340 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  41.11 
 
 
347 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 
351 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 
341 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.67 
 
 
334 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  42.68 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.47 
 
 
334 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  40.94 
 
 
374 aa  238  9e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.36 
 
 
334 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  42.38 
 
 
349 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  40.24 
 
 
349 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 
374 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  42.3 
 
 
366 aa  235  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 
352 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 
337 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  39.69 
 
 
353 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  39.44 
 
 
347 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 
355 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>