More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4253 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  97.3 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  97.3 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  97.3 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  96.22 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  96.22 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  94.59 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  92.97 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  91.89 
 
 		 185 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  89.73 
 
 		 185 aa  343  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  89.19 
 
 		 185 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  89.73 
 
 		 185 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  82.16 
 
 		 186 aa  317  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  81.08 
 
 		 186 aa  313  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  81.08 
 
 		 186 aa  307  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  80 
 
 		 186 aa  306  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  300  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  76.22 
 
 		 188 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  77.72 
 
 		 185 aa  293  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  76.63 
 
 		 185 aa  289  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  71.74 
 
 		 184 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  72.28 
 
 		 199 aa  275  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  69.35 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  67.38 
 
 		 189 aa  266  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  70.65 
 
 		 184 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  70.11 
 
 		 184 aa  264  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  69.02 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  69.02 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  67.39 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  260  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  65.78 
 
 		 188 aa  259  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  66.13 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  66.13 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  257  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  66.3 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  254  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  67.02 
 
 		 191 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  67.02 
 
 		 191 aa  250  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  57.75 
 
 		 186 aa  227  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  56.68 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  57.75 
 
 		 188 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  56.45 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  56.45 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  55.08 
 
 		 186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  54.3 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  56.99 
 
 		 186 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  56.99 
 
 		 186 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  56.99 
 
 		 186 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  56.99 
 
 		 186 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  56.99 
 
 		 186 aa  207  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  55.91 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  54.3 
 
 		 190 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  52.66 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  51.85 
 
 		 189 aa  190  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  51.32 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  51.85 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  50.53 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  50.53 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  50.53 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  50.53 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  44.21 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  40 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  36.76 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  36.56 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  36.56 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  36.9 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  37.3 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  36.76 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  34.59 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  36.07 
 
 		 211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  35.68 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  37.3 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  36.76 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  35.48 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  35.14 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  35.14 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  36.87 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  36.87 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  36.87 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  35.14 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  36.56 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  34.59 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>