More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4061 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 1107 aa  2295    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 716 aa  149  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 708 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 690 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 737 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.62 
 
 		 696 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  26.92 
 
 		 673 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 752 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  26.09 
 
 		 659 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 705 aa  121  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 699 aa  121  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  26.34 
 
 		 696 aa  119  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 662 aa  117  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 705 aa  116  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 703 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 703 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 704 aa  112  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.85 
 
 		 704 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 		 603 aa  112  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.45 
 
 		 704 aa  111  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  25.79 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 712 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  25.25 
 
 		 717 aa  108  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  24.75 
 
 		 683 aa  107  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.4 
 
 		 679 aa  97.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 685 aa  95.1  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  24.71 
 
 		 711 aa  94  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  23.56 
 
 		 734 aa  91.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 714 aa  91.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  25.39 
 
 		 687 aa  91.3  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  25.55 
 
 		 700 aa  89.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 		 710 aa  87.8  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 809 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  21.12 
 
 		 819 aa  85.5  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 821 aa  84.7  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 697 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.31 
 
 		 815 aa  78.2  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 671 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 695 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  23.77 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  27.8 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  23.01 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.61 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.42 
 
 		 615 aa  67.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  34.35 
 
 		 1232 aa  65.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.62 
 
 		 737 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 751 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.9 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 1033 aa  64.7  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 747 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.21 
 
 		 753 aa  64.3  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.21 
 
 		 751 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 751 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 758 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.23 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.91 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 751 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  24.52 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.77 
 
 		 753 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  19.81 
 
 		 659 aa  62.4  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.59 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.69 
 
 		 601 aa  61.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.32 
 
 		 837 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 		 741 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.64 
 
 		 900 aa  58.9  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 783 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  35.79 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  30.6 
 
 		 771 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  27.27 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  25.29 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  24.79 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  36.84 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  24.39 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.22 
 
 		 757 aa  57.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.72 
 
 		 786 aa  57.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 736 aa  57.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51910  Ankyrin  27.43 
 
 		 954 aa  57.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.11 
 
 		 775 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  23.29 
 
 		 619 aa  57.4  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 715 aa  57.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.92 
 
 		 932 aa  57  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  21.28 
 
 		 932 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  24.71 
 
 		 616 aa  57  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 797 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.03 
 
 		 785 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.66 
 
 		 780 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>