189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3887 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  95.18 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  94.78 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  97.19 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  93.17 
 
 		 249 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  97.19 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  97.19 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  85.94 
 
 		 249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  85.54 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  87.21 
 
 		 234 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  75.9 
 
 		 252 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  73.9 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  54.33 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  53.36 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  52.33 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  53.44 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  52.44 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  49.19 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  45.11 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  39.92 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  39.15 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  34.77 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  37.83 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  37.92 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  39.42 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  41.88 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  33.62 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  34.4 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  29.7 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  28.34 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  26.98 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.52 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.35 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30.13 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  37.84 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.16 
 
 		 285 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  27.63 
 
 		 272 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  28.23 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.74 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  26.81 
 
 		 322 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.74 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  32.8 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  24.77 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  28.72 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  26.7 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  23.87 
 
 		 278 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  28.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.96 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  36.27 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  28.08 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  29 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.34 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  27.09 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  28.92 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.08 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  28.64 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  28 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  28.08 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  34.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  28.08 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  28.08 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  26.54 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>