119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3566 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  100 
 
 
373 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  95.44 
 
 
373 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  91.69 
 
 
373 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  95.44 
 
 
373 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  89.01 
 
 
373 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  95.44 
 
 
373 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  91.69 
 
 
373 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  73.19 
 
 
373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  73.19 
 
 
373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  73.19 
 
 
373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  72.92 
 
 
373 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  72.92 
 
 
373 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  72.92 
 
 
373 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  72.92 
 
 
373 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  72.36 
 
 
369 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  66.58 
 
 
369 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  51.44 
 
 
337 aa  345  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  40.76 
 
 
365 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  43.72 
 
 
357 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  34.4 
 
 
371 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.53 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  31.82 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  31.72 
 
 
361 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.32 
 
 
365 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  29.92 
 
 
364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  31.65 
 
 
366 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  30.93 
 
 
366 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.27 
 
 
363 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  30.61 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  28.42 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  28.92 
 
 
372 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.17 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.5 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.27 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23.28 
 
 
371 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  24.68 
 
 
368 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  26.48 
 
 
372 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.13 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  37.04 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  23.42 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  32.81 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.93 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  35 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  27.7 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  26.89 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  32.12 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  36.57 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.46 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  30.91 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  28.89 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  29.17 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  26.29 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  33.09 
 
 
518 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  31.78 
 
 
533 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  33.09 
 
 
518 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  26.84 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  27.43 
 
 
522 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  22.82 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  30.07 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  26.71 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  25.65 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  35.9 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  24.84 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  35.9 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  25.65 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.41 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  24.86 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  28.93 
 
 
520 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  23.89 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.83 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  25.36 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  23.33 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.96 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  30.4 
 
 
789 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  31.82 
 
 
365 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  34.48 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  30 
 
 
534 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  32.11 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  30.7 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  31.43 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  30 
 
 
530 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  32.43 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  31.43 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  31.43 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  31.43 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  31.43 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  30.48 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  31.43 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  27.78 
 
 
524 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  31.82 
 
 
508 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  31.01 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  32.08 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  33.93 
 
 
533 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>