More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3408 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  100 
 
 
431 aa  810  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  83.1 
 
 
427 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  90.05 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  90.05 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  90.5 
 
 
427 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  91.25 
 
 
423 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  8.03869e-10 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  90.5 
 
 
425 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  71.53 
 
 
422 aa  454  1e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  65.21 
 
 
433 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  72.33 
 
 
433 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.91886e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  72.09 
 
 
422 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  6.23855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  72.33 
 
 
442 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  53.32 
 
 
416 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.85 
 
 
393 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 
402 aa  266  6e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  45.62 
 
 
401 aa  262  7e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 
402 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  47.1 
 
 
406 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.32 
 
 
405 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.28 
 
 
405 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  45.24 
 
 
396 aa  255  1e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  42.39 
 
 
404 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.86 
 
 
398 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.57 
 
 
405 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.33 
 
 
405 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.33 
 
 
405 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  41.56 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  41.56 
 
 
400 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  42.28 
 
 
395 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.71 
 
 
404 aa  246  5e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.46 
 
 
389 aa  245  1e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.46 
 
 
389 aa  245  1e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.16 
 
 
405 aa  239  7e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  47.17 
 
 
408 aa  239  7e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  41.06 
 
 
407 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  44.78 
 
 
413 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
419 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.41 
 
 
398 aa  222  1e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
447 aa  221  2e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
388 aa  221  2e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
419 aa  219  9e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  39.75 
 
 
398 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 
397 aa  214  3e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.64 
 
 
399 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  44.84 
 
 
401 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.64 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.61 
 
 
394 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.21 
 
 
385 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.37 
 
 
399 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  39.02 
 
 
399 aa  201  2e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.94 
 
 
415 aa  197  4e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  42.14 
 
 
399 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41 
 
 
389 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  40.79 
 
 
405 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  41.19 
 
 
399 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  43.19 
 
 
402 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
415 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  44.02 
 
 
399 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
399 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  32.03 
 
 
406 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  32.03 
 
 
406 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.71 
 
 
405 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  32.67 
 
 
403 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.07 
 
 
403 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
410 aa  186  1e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  30.48 
 
 
392 aa  184  2e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  39.9 
 
 
400 aa  184  2e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.83 
 
 
411 aa  183  4e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  35.43 
 
 
399 aa  183  5e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  35.43 
 
 
399 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  35.43 
 
 
399 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
387 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  39.52 
 
 
399 aa  181  3e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 
403 aa  181  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  43.44 
 
 
409 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.2 
 
 
395 aa  179  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  36.81 
 
 
394 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  36.81 
 
 
394 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  36.81 
 
 
394 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.04 
 
 
383 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  37.56 
 
 
400 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  35.95 
 
 
404 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.58 
 
 
394 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  36.81 
 
 
394 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
406 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  37.53 
 
 
399 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
394 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  35.77 
 
 
394 aa  174  2e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
413 aa  174  3e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
389 aa  173  4e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  33.42 
 
 
426 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  34.32 
 
 
407 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
394 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.15 
 
 
399 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  36.15 
 
 
394 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  37.31 
 
 
429 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  36.15 
 
 
394 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  37.31 
 
 
429 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  37.31 
 
 
398 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>