More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3338 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
595 aa  1207    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  64.31 
 
 
626 aa  788    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  80.55 
 
 
598 aa  953    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  81.74 
 
 
619 aa  962    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  46.82 
 
 
708 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  52.6 
 
 
828 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  50.7 
 
 
828 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  50.35 
 
 
828 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  50.69 
 
 
824 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  47.59 
 
 
789 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  50.54 
 
 
833 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 
833 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  48.26 
 
 
732 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 
754 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  46.14 
 
 
754 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
789 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  40.72 
 
 
585 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
627 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.5 
 
 
1106 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  34.24 
 
 
596 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.04 
 
 
589 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
1106 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
589 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
717 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
717 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 
776 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  34.89 
 
 
821 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  34.89 
 
 
821 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  34.89 
 
 
776 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  34.89 
 
 
776 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  34.89 
 
 
776 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
1714 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
776 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
718 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.67 
 
 
1221 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.5 
 
 
723 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.39 
 
 
1415 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 
780 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
780 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 
790 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.53 
 
 
790 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
633 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  33.1 
 
 
797 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.08 
 
 
699 aa  256  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
779 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
909 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.64 
 
 
781 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.75 
 
 
739 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
822 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
968 aa  253  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
3035 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.56 
 
 
708 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
796 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
3560 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
4489 aa  250  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
1143 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 
667 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
693 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.63 
 
 
937 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 
529 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.79 
 
 
740 aa  240  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
633 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
667 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
727 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.31 
 
 
739 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.75 
 
 
816 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
750 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
734 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.07 
 
 
715 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 
1144 aa  230  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.42 
 
 
739 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
713 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
647 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 
1094 aa  223  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
700 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.34 
 
 
921 aa  220  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.09 
 
 
742 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
1085 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
733 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
761 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
739 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
1116 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
654 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
808 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
647 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
974 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
632 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  27.39 
 
 
552 aa  196  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
740 aa  193  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.12 
 
 
553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
732 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
724 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
590 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.28 
 
 
726 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  27.71 
 
 
680 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
660 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 
793 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  31.64 
 
 
590 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>