More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3287 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.28 
 
 
291 aa  590  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.63 
 
 
291 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.97 
 
 
291 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.28 
 
 
291 aa  590  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.97 
 
 
291 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  98.28 
 
 
291 aa  590  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.53 
 
 
291 aa  577  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  94.85 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  95.19 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  89.46 
 
 
294 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  88.78 
 
 
294 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  87.46 
 
 
295 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.68 
 
 
291 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.68 
 
 
291 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.68 
 
 
291 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.34 
 
 
291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.57 
 
 
288 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.57 
 
 
290 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.57 
 
 
288 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  73.29 
 
 
291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  73.29 
 
 
293 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.85 
 
 
288 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.2 
 
 
288 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.29 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.82 
 
 
288 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.99 
 
 
289 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  71.23 
 
 
291 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  71.23 
 
 
291 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.07 
 
 
286 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.89 
 
 
293 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0107  ATP synthase F1, gamma subunit  67 
 
 
298 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0013955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  66.67 
 
 
291 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.04 
 
 
289 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.04 
 
 
289 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.29 
 
 
290 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.11 
 
 
288 aa  358  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.11 
 
 
288 aa  358  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  57.39 
 
 
289 aa  354  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
288 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.64 
 
 
287 aa  341  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.3 
 
 
287 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.39 
 
 
286 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.39 
 
 
286 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.64 
 
 
286 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.64 
 
 
286 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.26 
 
 
287 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.7 
 
 
288 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
287 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  56.36 
 
 
288 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.3 
 
 
286 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.82 
 
 
287 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.82 
 
 
287 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.82 
 
 
287 aa  332  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.95 
 
 
286 aa  331  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.92 
 
 
287 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.67 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.67 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.67 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.67 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.3 
 
 
286 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.92 
 
 
286 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.01 
 
 
286 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.36 
 
 
286 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.36 
 
 
286 aa  329  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.67 
 
 
286 aa  328  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.61 
 
 
286 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.33 
 
 
286 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.61 
 
 
286 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.7 
 
 
289 aa  328  7e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  53.26 
 
 
287 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.56 
 
 
293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.58 
 
 
289 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.26 
 
 
287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.01 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  54.64 
 
 
286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.42 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.55 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.64 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>