More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3273 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  75.26 
 
 		 608 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1041    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  61.15 
 
 		 951 aa  698    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  62.94 
 
 		 597 aa  713    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  64.92 
 
 		 950 aa  760    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  75.08 
 
 		 613 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  96.46 
 
 		 594 aa  1148    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  73.83 
 
 		 608 aa  827    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  100 
 
 		 594 aa  1181    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  85.86 
 
 		 594 aa  1032    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.42 
 
 		 589 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  59.38 
 
 		 590 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  58.75 
 
 		 598 aa  695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  59.83 
 
 		 590 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  56.57 
 
 		 599 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  63.87 
 
 		 597 aa  708    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  88.38 
 
 		 594 aa  1068    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  60.25 
 
 		 590 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  59.69 
 
 		 589 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  73.83 
 
 		 608 aa  827    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  87.88 
 
 		 594 aa  1060    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  75.09 
 
 		 617 aa  846    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  61.32 
 
 		 593 aa  738    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  98.15 
 
 		 594 aa  1161    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  97.98 
 
 		 594 aa  1159    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1043    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1041    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  60.93 
 
 		 589 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  98.32 
 
 		 594 aa  1162    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  86.87 
 
 		 594 aa  1053    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  97.64 
 
 		 594 aa  1154    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  86.87 
 
 		 594 aa  1042    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  63.57 
 
 		 604 aa  707    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  59.18 
 
 		 588 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  97.98 
 
 		 594 aa  1158    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  58.21 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  57.07 
 
 		 630 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  53.5 
 
 		 583 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  52.49 
 
 		 589 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  58.04 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  56.43 
 
 		 631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  52.12 
 
 		 954 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  52.99 
 
 		 595 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  50.69 
 
 		 604 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.41 
 
 		 596 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 589 aa  528  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  55.04 
 
 		 625 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  49.56 
 
 		 590 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  37.69 
 
 		 599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  35.04 
 
 		 614 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  35.24 
 
 		 663 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.68 
 
 		 606 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  37.28 
 
 		 608 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.86 
 
 		 643 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.38 
 
 		 648 aa  297  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  34.29 
 
 		 593 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  37.5 
 
 		 611 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  34.29 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  34.02 
 
 		 646 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  35.1 
 
 		 593 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.91 
 
 		 647 aa  289  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  36.06 
 
 		 612 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  35.98 
 
 		 823 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.55 
 
 		 646 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  35.98 
 
 		 823 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  34.98 
 
 		 678 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  34.98 
 
 		 679 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.89 
 
 		 643 aa  276  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  34.66 
 
 		 682 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.62 
 
 		 827 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.55 
 
 		 852 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.86 
 
 		 832 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  31.77 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  33.55 
 
 		 606 aa  266  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  34.21 
 
 		 830 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  32.8 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  35.98 
 
 		 822 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.51 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  34.37 
 
 		 616 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 256 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.38 
 
 		 616 aa  253  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.68 
 
 		 632 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  30.76 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  32.09 
 
 		 838 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 609 aa  244  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  32.18 
 
 		 842 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.4 
 
 		 828 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  33.91 
 
 		 624 aa  243  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  44.85 
 
 		 284 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  49.07 
 
 		 280 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  50.4 
 
 		 265 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  49 
 
 		 261 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  48.18 
 
 		 334 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50 
 
 		 276 aa  240  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  32.64 
 
 		 603 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>