More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3272 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  96.3 
 
 		 351 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 351 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  96.01 
 
 		 351 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  98.01 
 
 		 394 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  96.01 
 
 		 351 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  98.01 
 
 		 394 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  97.72 
 
 		 351 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 		 351 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  86 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  86 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  86 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  86 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  86 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  80.34 
 
 		 351 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  80.34 
 
 		 351 aa  547  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 		 351 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  80.63 
 
 		 351 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  71.14 
 
 		 350 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  70.66 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  70.86 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  69.14 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  69.14 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  59.31 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  61.43 
 
 		 951 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  62.57 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  56.57 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  61.14 
 
 		 345 aa  361  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  55.84 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  58.29 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  59.65 
 
 		 950 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  50.29 
 
 		 345 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  54 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  55.14 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  51.52 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  53.56 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  53.28 
 
 		 346 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  54.13 
 
 		 345 aa  311  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52.57 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  50.58 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  50.42 
 
 		 347 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.13 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  58.4 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  47.29 
 
 		 954 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.22 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  48.44 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  38.22 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 300 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  33.18 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  30.96 
 
 		 287 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  26.39 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  28.45 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>