86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3238 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  93.23 
 
 
133 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  93.23 
 
 
133 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  93.23 
 
 
133 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  90.98 
 
 
133 aa  219  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  94.87 
 
 
117 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  86.99 
 
 
145 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  83.59 
 
 
134 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  83.59 
 
 
136 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  83.59 
 
 
136 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  82.81 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  82.81 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  82.81 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  82.81 
 
 
134 aa  186  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  81.54 
 
 
134 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  72.79 
 
 
143 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  73.17 
 
 
138 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  73.17 
 
 
138 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  52.54 
 
 
134 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  52.5 
 
 
134 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  50 
 
 
146 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  51.28 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  48.31 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  48.31 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  43.75 
 
 
135 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  45.19 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  42.45 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  46.4 
 
 
130 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  44.17 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  39.66 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  45.16 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  42.11 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  39.81 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  40.37 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  38 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  40.66 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  45.56 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  35.71 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  48.31 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  41.86 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  35.35 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  35.35 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  34.34 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  34.34 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  34.34 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  31.03 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  47.46 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.62 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  29.01 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  34.34 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  29.31 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  39.44 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  35.35 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  37.21 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  27.45 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  42.59 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  27.2 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  47.83 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  39.06 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  27.34 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  30.3 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  25.86 
 
 
131 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
122 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  36.51 
 
 
125 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  30.69 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  36.99 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  28.43 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  37.5 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
326 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  54.55 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  41.51 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3266  MshA pilin protein MshD  28.24 
 
 
144 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>