32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3209 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  206  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  79.25 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  79.25 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  79.25 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  66.04 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  66.02 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  47.27 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  55.56 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0025  hypothetical protein  51.43 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  42.73 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  49.15 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  49.15 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  46.15 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  45.16 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  44.44 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  44.14 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  45.05 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  40.79 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  40.79 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  38.96 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3825  hypothetical protein  40.96 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.347228  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  36.96 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  36.96 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  36.96 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  37.63 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0109  hypothetical protein  40.24 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450953  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2984  hypothetical protein  35.87 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.272104  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2411  hypothetical protein  35.87 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  47.22 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>