More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3195 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  100 
 
 
176 aa  340  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  3.8673e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  93.75 
 
 
176 aa  323  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.72347e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  93.75 
 
 
176 aa  323  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  8.53372e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  93.18 
 
 
177 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  6.93928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  90.34 
 
 
177 aa  315  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  89.2 
 
 
176 aa  310  5e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.67547e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  89.77 
 
 
176 aa  310  7e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.61036e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  82.66 
 
 
175 aa  277  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  80.35 
 
 
175 aa  271  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  80.35 
 
 
174 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.03628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  80.35 
 
 
175 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  61.27 
 
 
177 aa  185  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  59.88 
 
 
178 aa  184  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  59.77 
 
 
179 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  56 
 
 
190 aa  182  2e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  57.89 
 
 
188 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  57.89 
 
 
188 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  61.76 
 
 
181 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  55.69 
 
 
191 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  58.9 
 
 
177 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  60.12 
 
 
188 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  57.95 
 
 
188 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  57.67 
 
 
177 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  60.95 
 
 
179 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  59.51 
 
 
177 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  53.45 
 
 
178 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  57.67 
 
 
177 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  52.66 
 
 
177 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  52.69 
 
 
180 aa  132  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  50.88 
 
 
177 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  56.65 
 
 
200 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  50.29 
 
 
174 aa  116  2e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.08 
 
 
178 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.57 
 
 
185 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  39.31 
 
 
184 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  34.07 
 
 
186 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  35.29 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  39.88 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  34.07 
 
 
186 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  34.07 
 
 
186 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.07 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  33.53 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  34.27 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  34.3 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.57 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.21 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.46 
 
 
203 aa  94.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.06 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  33.71 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  36.69 
 
 
197 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.78 
 
 
191 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.97 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.57 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  34.48 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.87 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  34.55 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  39.16 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.54 
 
 
183 aa  90.9  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  34.81 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.39 
 
 
186 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.14 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  37.57 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.76 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  33.7 
 
 
222 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  36.36 
 
 
181 aa  89  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.69 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.63 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  40.85 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.63 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  35.75 
 
 
197 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  5.75966e-05  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.53 
 
 
195 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.42 
 
 
193 aa  84  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  31.48 
 
 
188 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  32.35 
 
 
193 aa  84  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  33.53 
 
 
180 aa  83.2  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.61 
 
 
173 aa  83.2  2e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  37.08 
 
 
182 aa  82.8  2e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  32.35 
 
 
206 aa  82  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.12 
 
 
190 aa  81.6  5e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.47 
 
 
203 aa  81.3  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  32.18 
 
 
176 aa  80.9  9e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  31.76 
 
 
193 aa  80.9  9e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  37.35 
 
 
172 aa  80.5  1e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  29.82 
 
 
175 aa  80.1  1e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.13 
 
 
188 aa  80.5  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  30.68 
 
 
179 aa  80.5  1e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  31.98 
 
 
174 aa  79.7  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 
174 aa  79.7  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 
174 aa  79.7  2e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.21 
 
 
182 aa  79.7  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.14 
 
 
175 aa  79.3  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  29.82 
 
 
175 aa  79.7  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  35.42 
 
 
416 aa  79  3e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  32.42 
 
 
190 aa  79  3e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  34.15 
 
 
181 aa  77.8  8e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  31.71 
 
 
182 aa  77  1e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.95 
 
 
187 aa  76.3  2e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.94 
 
 
191 aa  75.9  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.94 
 
 
179 aa  75.9  3e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>