11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3187 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3187  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  30.56 
 
 
637 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  28.21 
 
 
635 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>