More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7028 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 342 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  77.19 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  97.06 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  97.06 
 
 		 355 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  41.39 
 
 		 374 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  41.19 
 
 		 475 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 470 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 475 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 460 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 460 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  42.32 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  43.15 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  38.8 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  40.91 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.08 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.35 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.05 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.75 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.03 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.49 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.55 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.46 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.85 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  39.04 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.28 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 		 375 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.65 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 		 363 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.2 
 
 		 348 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.65 
 
 		 344 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.86 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  34.79 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  40.61 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.44 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.21 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  38.46 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.74 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.1 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.95 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.07 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  37.35 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.71 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  40.4 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  42.81 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  39 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.45 
 
 		 349 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>