More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7020 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  99.75 
 
 
405 aa  782  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  89.83 
 
 
405 aa  667  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  99.75 
 
 
405 aa  782  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  92.31 
 
 
405 aa  701  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  91.81 
 
 
405 aa  698  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  784  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  80.94 
 
 
404 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  79.7 
 
 
404 aa  607  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  80.22 
 
 
388 aa  540  1e-152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  72.43 
 
 
400 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  72.43 
 
 
400 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  72.16 
 
 
400 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  66.31 
 
 
395 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  66.76 
 
 
398 aa  468  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  66.49 
 
 
398 aa  461  1e-128  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  59.54 
 
 
400 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  59.38 
 
 
401 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50.26 
 
 
393 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  60.56 
 
 
399 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  61.2 
 
 
399 aa  362  7e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  60.68 
 
 
399 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  60.89 
 
 
399 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  63.71 
 
 
402 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  51.47 
 
 
398 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  51.46 
 
 
401 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  45.67 
 
 
389 aa  313  3e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  45.67 
 
 
389 aa  313  3e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  48.48 
 
 
396 aa  307  2e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  48.57 
 
 
402 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  47.28 
 
 
406 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
402 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  44.25 
 
 
407 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  51.47 
 
 
408 aa  283  4e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
447 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  47.37 
 
 
413 aa  269  6e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
413 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.32 
 
 
399 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  44.35 
 
 
405 aa  254  2e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  38.4 
 
 
392 aa  252  8e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.51 
 
 
399 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  38.08 
 
 
406 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.25 
 
 
399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  38.08 
 
 
406 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  38.08 
 
 
403 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.53 
 
 
416 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.71 
 
 
399 aa  246  5e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.1 
 
 
385 aa  245  1e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  49.02 
 
 
409 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.06 
 
 
394 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.07 
 
 
399 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.99 
 
 
383 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.07 
 
 
399 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.07 
 
 
399 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  41.19 
 
 
425 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37.11 
 
 
403 aa  223  5e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.75 
 
 
394 aa  221  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.75 
 
 
394 aa  221  2e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.75 
 
 
394 aa  221  2e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.75 
 
 
394 aa  221  2e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
387 aa  221  2e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
406 aa  221  2e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
399 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
413 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
397 aa  217  3e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.25 
 
 
394 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.75 
 
 
394 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.75 
 
 
405 aa  216  6e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.2 
 
 
389 aa  216  6e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
406 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
389 aa  214  2e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.26 
 
 
395 aa  213  3e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  43.7 
 
 
391 aa  213  5e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.44 
 
 
394 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.52 
 
 
399 aa  212  8e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.52 
 
 
405 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  40.64 
 
 
431 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.8 
 
 
394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
403 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.8 
 
 
394 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.8 
 
 
394 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.8 
 
 
394 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39.68 
 
 
403 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
391 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  37.81 
 
 
404 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.43 
 
 
411 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.55 
 
 
394 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.52 
 
 
401 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 
410 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
413 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
394 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.65 
 
 
433 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  41.49 
 
 
427 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
408 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  37.18 
 
 
401 aa  201  1e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
423 aa  201  2e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>