More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6966 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  99.73 
 
 		 388 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  99.73 
 
 		 388 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 365 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  38.57 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  37.02 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  37.71 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  39.35 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  39.35 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  39.35 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.6 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  35.77 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.68 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  37.74 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  34.96 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  37.67 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  33.33 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  32.58 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.7 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.36 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  33.61 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  34.17 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.93 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.08 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.78 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.22 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.4 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.22 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0065  LacI family transcription regulator  32.22 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0064  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  30.49 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.89 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  33.51 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0063  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0065  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000194735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.78 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0061  LacI family transcription regulator  31 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000329359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  33.88 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  30.96 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  32.5 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  33.61 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  30.77 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  34.08 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.81 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  33.6 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0564  transcriptional regulator, LacI family  28.19 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.432352  normal  0.0264238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.98 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  31.71 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.37 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  29.72 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.56 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.56 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  24.93 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>