121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6844 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  246  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  59.48 
 
 
123 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  57.63 
 
 
119 aa  139  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  52.17 
 
 
128 aa  115  1e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  50.43 
 
 
127 aa  112  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  43.8 
 
 
123 aa  112  2e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  47.83 
 
 
132 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  46.15 
 
 
135 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  45.83 
 
 
127 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  45.83 
 
 
127 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  47.06 
 
 
134 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  45.38 
 
 
131 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  45.76 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  41.44 
 
 
129 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  44.92 
 
 
140 aa  82  3e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  43.1 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  42.72 
 
 
133 aa  79  2e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  41.51 
 
 
138 aa  77.4  7e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  74.3  5e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  40.87 
 
 
138 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  36.79 
 
 
128 aa  72.4  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.52 
 
 
139 aa  68.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  38.6 
 
 
130 aa  68.6  3e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  38.38 
 
 
132 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  33.06 
 
 
141 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.02 
 
 
132 aa  61.6  4e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.91 
 
 
139 aa  60.5  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  31.86 
 
 
143 aa  60.1  1e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.96 
 
 
136 aa  59.7  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  36.97 
 
 
146 aa  59.7  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  35.51 
 
 
132 aa  59.7  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.54 
 
 
138 aa  59.3  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.74 
 
 
132 aa  58.5  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  58.9  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  32.79 
 
 
140 aa  57.4  6e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  40.51 
 
 
311 aa  57  8e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  34.58 
 
 
146 aa  57  9e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32.04 
 
 
132 aa  56.6  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.61 
 
 
319 aa  56.6  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.74 
 
 
136 aa  55.8  2e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  41.76 
 
 
132 aa  54.7  4e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  39.53 
 
 
317 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  39.53 
 
 
318 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  39.53 
 
 
318 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.43 
 
 
311 aa  54.3  6e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  53.9  7e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  35.85 
 
 
312 aa  53.9  7e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.17 
 
 
137 aa  53.5  9e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.33 
 
 
132 aa  53.1  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.82 
 
 
137 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  35.4 
 
 
137 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.84 
 
 
130 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  39.29 
 
 
149 aa  52.4  2e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  28.32 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  33.04 
 
 
141 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.45 
 
 
120 aa  52  3e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  40.3 
 
 
324 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.58 
 
 
137 aa  51.6  4e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 
130 aa  51.2  5e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  39.25 
 
 
315 aa  51.2  5e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  33.94 
 
 
338 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  34.21 
 
 
145 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  34.21 
 
 
145 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  34.21 
 
 
145 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.52 
 
 
148 aa  50.8  6e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  33.94 
 
 
332 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  41.67 
 
 
321 aa  50.8  6e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.19 
 
 
130 aa  50.8  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  27.62 
 
 
129 aa  50.4  9e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  50.1  9e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.93 
 
 
136 aa  50.1  1e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  37.65 
 
 
317 aa  49.7  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.63 
 
 
137 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  45.9 
 
 
333 aa  50.1  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  36.46 
 
 
131 aa  49.3  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.42 
 
 
133 aa  49.7  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  27.64 
 
 
153 aa  49.7  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.41 
 
 
144 aa  48.1  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30 
 
 
178 aa  48.1  4e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  32.71 
 
 
334 aa  47  9e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50735e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  35.24 
 
 
319 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  35.29 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.14 
 
 
541 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  32.46 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  31.78 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  35.05 
 
 
322 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  33.67 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.42 
 
 
189 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  35.11 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.79 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  30.09 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  24.14 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  28.23 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  34.91 
 
 
320 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  24.74 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>