More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6789 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  63.56 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  63.56 
 
 
221 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  63.56 
 
 
221 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  63.56 
 
 
221 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  64.44 
 
 
224 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  63.11 
 
 
220 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  63.56 
 
 
220 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  47.58 
 
 
220 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  48.02 
 
 
220 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  47.58 
 
 
220 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.46 
 
 
220 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  47.14 
 
 
220 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  46.26 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
231 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 
243 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
242 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  39.91 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.79 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 
266 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  33.75 
 
 
267 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  36.99 
 
 
223 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  37.21 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  37.21 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  36.28 
 
 
236 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  36.28 
 
 
236 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  36.28 
 
 
236 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  37.21 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 
240 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
218 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
218 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  46.28 
 
 
207 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
242 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
219 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 
239 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
210 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.45 
 
 
319 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.59 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
219 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.12 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.94 
 
 
607 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.62 
 
 
330 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45.3 
 
 
375 aa  95.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.1 
 
 
294 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.31 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.46 
 
 
321 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.81 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  43.12 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  43.12 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 
376 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  46.3 
 
 
334 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.18 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.04 
 
 
222 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  41.05 
 
 
217 aa  89  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  41.05 
 
 
219 aa  89  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  45.54 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.52 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
166 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  41.03 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  43.56 
 
 
903 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.55 
 
 
420 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  41.03 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  41.03 
 
 
179 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  41.03 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  41.03 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  41.03 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  41.03 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  41.03 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  45.95 
 
 
331 aa  85.1  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.74 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.54 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.39 
 
 
609 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.96 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  42.57 
 
 
464 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.4 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.35 
 
 
509 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.37 
 
 
669 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>