More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6598 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
321 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  96.88 
 
 
321 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  96.88 
 
 
321 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  85.48 
 
 
314 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  83.71 
 
 
314 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  83.71 
 
 
317 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  78.59 
 
 
333 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.97 
 
 
306 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1969  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  55.56 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  56.62 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.22 
 
 
307 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.06 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.92 
 
 
306 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.87 
 
 
306 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.73 
 
 
301 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.06 
 
 
307 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.06 
 
 
309 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.85 
 
 
304 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.85 
 
 
304 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.54 
 
 
304 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.92 
 
 
306 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.58 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  39.26 
 
 
303 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  36.25 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.05 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.32 
 
 
300 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.4 
 
 
298 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.32 
 
 
303 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.05 
 
 
295 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.69 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.32 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2017  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.87 
 
 
297 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.46 
 
 
299 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.63 
 
 
278 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.3 
 
 
294 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.29 
 
 
281 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30 
 
 
291 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.76 
 
 
286 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.96 
 
 
292 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.95 
 
 
294 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.62 
 
 
294 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.55 
 
 
307 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.21 
 
 
296 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.08 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.77 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.64 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0747  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.96 
 
 
290 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.14 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1561  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.38 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.45 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.34 
 
 
723 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.46 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.94 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1063  hypothetical protein  27.92 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.96 
 
 
284 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.97 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.16 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3917  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.9 
 
 
284 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0252378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.76 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.7 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.67 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.79 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.1 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.9 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.89 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.42 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2034  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.13 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.89 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1537  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.35 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.77 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.78 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13108  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.37 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.8 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  28.21 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.83 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.73 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.18 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.46 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.73 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.05 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.79 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0418  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.24 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.01 
 
 
280 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.57 
 
 
286 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.29 
 
 
297 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0776  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.83 
 
 
295 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.43 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.21 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2888  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.18 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.124362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.39 
 
 
738 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.67 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.37 
 
 
286 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.8 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4165  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.75 
 
 
296 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2239  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.31 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.01 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>