More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6588 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  99.28 
 
 
415 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  96.14 
 
 
415 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  100 
 
 
415 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  89.64 
 
 
415 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  99.28 
 
 
415 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  78.42 
 
 
415 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  78.18 
 
 
415 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  76.18 
 
 
491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  76.03 
 
 
418 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  68.23 
 
 
410 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  68.4 
 
 
410 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  68.72 
 
 
410 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  64.77 
 
 
412 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  63.37 
 
 
412 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  68.64 
 
 
408 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  46.08 
 
 
418 aa  375  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  40.62 
 
 
432 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  40.38 
 
 
432 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  40.62 
 
 
433 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
433 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
432 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  40.62 
 
 
432 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
433 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  40.62 
 
 
433 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  40.82 
 
 
432 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  39.9 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  40.38 
 
 
432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  35.19 
 
 
415 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  34.94 
 
 
423 aa  243  6e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  35.73 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  35.5 
 
 
432 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  34.35 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  36 
 
 
435 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  35 
 
 
434 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  35.15 
 
 
432 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  35 
 
 
434 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  37.5 
 
 
428 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  34.87 
 
 
428 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  36.41 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  35.66 
 
 
441 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  34.21 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  33.17 
 
 
423 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  34.62 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  35.37 
 
 
428 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  35.37 
 
 
428 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  36.57 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  37.6 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  37.6 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  35.13 
 
 
428 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  37.34 
 
 
420 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  34.36 
 
 
409 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  37.08 
 
 
420 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
436 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  34.18 
 
 
434 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 
419 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  34.1 
 
 
428 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
430 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  32.66 
 
 
411 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  36.15 
 
 
419 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  36.22 
 
 
429 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  33.25 
 
 
409 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
434 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  34.22 
 
 
427 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  34.6 
 
 
425 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  36.64 
 
 
424 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  34.6 
 
 
425 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  36.64 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  36.39 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  35.44 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 
429 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  32.5 
 
 
429 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.15 
 
 
436 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  35.2 
 
 
437 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  33.5 
 
 
423 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
474 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  35.05 
 
 
474 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  34.8 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  34.8 
 
 
457 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  35.13 
 
 
435 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  34.8 
 
 
474 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  34.8 
 
 
457 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  34.8 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
433 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  32.28 
 
 
445 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  32.28 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  32.28 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  33.42 
 
 
429 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
415 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
415 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  32.91 
 
 
428 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  32.56 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  30.57 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  34.2 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  29.3 
 
 
421 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  29.74 
 
 
427 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  29.74 
 
 
427 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  33.67 
 
 
432 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  28.57 
 
 
421 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>