More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6548 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  98.13 
 
 		 374 aa  732    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  98.13 
 
 		 374 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  87.7 
 
 		 374 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  50.96 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  52.12 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  49.18 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  45.9 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  47.31 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  45.27 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  45.5 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  41.14 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  40 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  39.01 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  44.67 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  30.26 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 983 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 984 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.42 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.17 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.29 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.6 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.43 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.22 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.08 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.21 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.73 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  26.5 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  26.5 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.89 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.89 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.68 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.89 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.89 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.01 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 411 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.01 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.45 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.13 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.13 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.73 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  30.13 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.45 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.45 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.43 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 960 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.48 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 396 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>