91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6531 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  78.61 
 
 		 414 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  85.17 
 
 		 419 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  95.67 
 
 		 416 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  95.67 
 
 		 416 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  100 
 
 		 416 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  84.69 
 
 		 419 aa  725    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  77.64 
 
 		 414 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  90.38 
 
 		 414 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  76.92 
 
 		 413 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  62.86 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  56.17 
 
 		 407 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  47.94 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  47.84 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  47.7 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  47.12 
 
 		 392 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  45.61 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  46.59 
 
 		 392 aa  339  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  45.54 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  44.23 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  43.45 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  46.75 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  42.2 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  43.03 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.63 
 
 		 422 aa  305  8.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  43.28 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  43.41 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  42.41 
 
 		 419 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  42.41 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  41.89 
 
 		 420 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  41.2 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  41.2 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  39.28 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  40.39 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  39.76 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  41.67 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  42.3 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  39.46 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  41.63 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  41.59 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  38 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  39.52 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.33 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  36.19 
 
 		 418 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.53 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  33.8 
 
 		 502 aa  199  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.44 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.47 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.5 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.6 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  36.75 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  36.87 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.4 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.94 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  31.13 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  27.29 
 
 		 1506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  26.95 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  38.36 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  34.46 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  32.21 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  32.57 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  30.34 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  27.8 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  28.77 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  30.48 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  28.11 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  33.55 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  30.65 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  26.04 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  28.46 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  34.82 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  25.44 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  27.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  26.32 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  27.81 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  28.08 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  32.7 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  23.61 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  26.03 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.89 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  22.92 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  23.13 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  28 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  29.87 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>