More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6489 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  98.54 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  98.54 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  87.82 
 
 
274 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  86.35 
 
 
274 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  84.5 
 
 
274 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  62.03 
 
 
273 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  62.03 
 
 
273 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  62.03 
 
 
328 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  62.03 
 
 
372 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  62.03 
 
 
328 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  60.53 
 
 
271 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  58.27 
 
 
274 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  57.89 
 
 
274 aa  314  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  58.62 
 
 
285 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  61.11 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 
267 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  49.62 
 
 
277 aa  244  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  46.97 
 
 
277 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 
276 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  46.1 
 
 
275 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 
276 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 
276 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  46.21 
 
 
271 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
276 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 
278 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 
276 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 
280 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 
276 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  47.53 
 
 
276 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  45.17 
 
 
270 aa  218  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
284 aa  214  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  45.8 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 
270 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.32 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  33.95 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
264 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
263 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
264 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.18 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
265 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.6 
 
 
263 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
265 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
264 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.43 
 
 
283 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.36 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  31.01 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.43 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.2 
 
 
259 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.34 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.54 
 
 
425 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
277 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
262 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
258 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.42 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 
256 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>