More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6485 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  89.3 
 
 
201 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  89.3 
 
 
201 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  85.03 
 
 
201 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  62.16 
 
 
201 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.92 
 
 
202 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  56.37 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.06 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  55.22 
 
 
202 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.4 
 
 
216 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.26 
 
 
208 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.26 
 
 
208 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.85 
 
 
204 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.45 
 
 
203 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.38 
 
 
203 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.58 
 
 
213 aa  201  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  58.6 
 
 
202 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.38 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.37 
 
 
217 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  54.74 
 
 
208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.12 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  52.79 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.55 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  55.03 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  54.5 
 
 
203 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  54.5 
 
 
203 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.63 
 
 
203 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.91 
 
 
215 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.75 
 
 
214 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.75 
 
 
214 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  53.97 
 
 
203 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  55.68 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  55.68 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.49 
 
 
205 aa  188  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  54.84 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  50.76 
 
 
202 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.65 
 
 
216 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  48.11 
 
 
216 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.25 
 
 
232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  49.49 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.25 
 
 
232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  49.01 
 
 
206 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  53.23 
 
 
202 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.27 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.25 
 
 
232 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.94 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.94 
 
 
207 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.25 
 
 
182 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 
204 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.22 
 
 
209 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.21 
 
 
197 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 
207 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.73 
 
 
207 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  46.04 
 
 
199 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.39 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.78 
 
 
199 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.37 
 
 
213 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.86 
 
 
213 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.27 
 
 
199 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
199 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
199 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.72 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
207 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.57 
 
 
198 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  42.57 
 
 
198 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  42.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  41.15 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.21 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.21 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.81 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.71 
 
 
198 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
209 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.09 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.95 
 
 
199 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.81 
 
 
210 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.95 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.21 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.11 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.7 
 
 
198 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  41.11 
 
 
209 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.12 
 
 
204 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  42.86 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
199 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.97 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  40.1 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.5 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  40.2 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.29 
 
 
201 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 
204 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>