More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6467 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6467  aminotransferase class V  100 
 
 		 419 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5603  aminotransferase, class V  96.66 
 
 		 419 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6253  aminotransferase, class V  90.82 
 
 		 440 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5967  aminotransferase, class V  96.66 
 
 		 419 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3931  aminotransferase class V  67.15 
 
 		 438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0206  aminotransferase, class V  63.05 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1280  aminotransferase class V  32.75 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1680  selenocysteine lyase-like protein  27.23 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  27.58 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  24.75 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  27.74 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  25.56 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  23.04 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  23.28 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  23.23 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  23.54 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  29.05 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  27.11 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  23.56 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  24.12 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  24.22 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  31.63 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.28 
 
 		 885 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  28.73 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  22.94 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  22.94 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  24.18 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  31.51 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.33 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  26.01 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.27 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  22.88 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.3 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.72 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  22.65 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  22.65 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  21.59 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  22.27 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  20.42 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.25 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  22.65 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  22.35 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.54 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.45 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  24.29 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.47 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  22.35 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  22.35 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  22.35 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.36 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  24.18 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.9 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  27.53 
 
 		 879 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  28.44 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.47 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.46 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.65 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.74 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.36 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.09 
 
 		 664 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.32 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.76 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.56 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  22.37 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.65 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.22 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.36 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.78 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  24.06 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.29 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.64 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  23.72 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  26.15 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.01 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.03 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.13 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.03 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.1 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.86 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.08 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.84 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  25.77 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  22.73 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.14 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.51 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.53 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  25.42 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  26.62 
 
 		 896 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.21 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  22.73 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.23 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  25.94 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.69 
 
 		 673 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  26.29 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  24.07 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  22.8 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>