More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6427 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  99.34 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  99.01 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  86.18 
 
 		 304 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  85.86 
 
 		 304 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  72.48 
 
 		 304 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  70.13 
 
 		 307 aa  441  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  72.82 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  70.31 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  68.98 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  69.9 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  69.8 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  59.25 
 
 		 303 aa  345  8e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  55.29 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  54.9 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  54.96 
 
 		 261 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.07 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  53.33 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  52.94 
 
 		 259 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.51 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  52.94 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  52.57 
 
 		 259 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.56 
 
 		 258 aa  266  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  53.94 
 
 		 274 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.82 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50.39 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  55.17 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.17 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.78 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  51.42 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.42 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.56 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.06 
 
 		 252 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.76 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  50.79 
 
 		 259 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.76 
 
 		 254 aa  255  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.81 
 
 		 263 aa  255  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  52.32 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  56.83 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.6 
 
 		 252 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.77 
 
 		 253 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51.22 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.82 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.39 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.17 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  52.26 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.62 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  50.86 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  47.17 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  56.87 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  52.08 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.41 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.61 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  55.83 
 
 		 258 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  48.56 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  55.07 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.62 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.62 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.57 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  55.51 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.36 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  54.63 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.51 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.62 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  53.07 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.23 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  54.32 
 
 		 262 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  53.78 
 
 		 262 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  51.11 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  52.61 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  53.78 
 
 		 262 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  53.78 
 
 		 262 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  50.2 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  49.79 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  48.88 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.13 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.04 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.72 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  53.33 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49 
 
 		 261 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.61 
 
 		 269 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.75 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 		 311 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.23 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.56 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.75 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>