158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6373 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 
279 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  98.92 
 
 
279 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  98.92 
 
 
279 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  94.62 
 
 
279 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  92.17 
 
 
281 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  91.81 
 
 
281 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  77.42 
 
 
279 aa  400  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  75.8 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  75.8 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  75.8 
 
 
281 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  69.58 
 
 
283 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  67.84 
 
 
280 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  69.86 
 
 
281 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  61.94 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  58.39 
 
 
282 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  59.03 
 
 
284 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  59.49 
 
 
269 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  63.76 
 
 
283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  56.64 
 
 
286 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  52.3 
 
 
280 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  54.77 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  46.76 
 
 
266 aa  188  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  41.39 
 
 
263 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  43.78 
 
 
262 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  38.87 
 
 
292 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  37.44 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  40.46 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  35.98 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  37.61 
 
 
289 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  38.53 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  34.71 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  36.78 
 
 
274 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  41.06 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  39.09 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  34.48 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  40.58 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  38.05 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  35.47 
 
 
291 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  40.31 
 
 
291 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  34.7 
 
 
305 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  35.19 
 
 
272 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  36.32 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  39.3 
 
 
309 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  35.44 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  35.64 
 
 
265 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  32.48 
 
 
342 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.78 
 
 
260 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  36.51 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.86 
 
 
266 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  34.24 
 
 
280 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  33.62 
 
 
275 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  34.17 
 
 
267 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.77 
 
 
345 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  34.17 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  32.02 
 
 
260 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.17 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  34 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  31.28 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  37.06 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  33.18 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  29.09 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  30.99 
 
 
266 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.46 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  30.57 
 
 
234 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.02 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  34.38 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  34.5 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  34.38 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  29.02 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  32 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  34.72 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  31.84 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  29.66 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  31.65 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  35.75 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  28.29 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  28.29 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  31.86 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  33.82 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  31.56 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  31.11 
 
 
342 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.34 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.51 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.49 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.63 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  27.07 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  27.97 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  28.45 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  30.77 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.56 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  27.02 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  29.25 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  30.85 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.97 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.61 
 
 
233 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  28.79 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.59 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  30.2 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  30.2 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>