40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6223 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  313  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  96.75 
 
 		 154 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  96.75 
 
 		 154 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  77.21 
 
 		 150 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  41.48 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  46.34 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  37.69 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  40 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  38.17 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  34.04 
 
 		 599 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  33.67 
 
 		 563 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  34.65 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  38.71 
 
 		 580 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  37.11 
 
 		 580 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  32.59 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  39.56 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  32.29 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  32.26 
 
 		 563 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  32.99 
 
 		 580 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  32.93 
 
 		 652 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  31.25 
 
 		 576 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  28.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  39.76 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  38.54 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  33.83 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  32.21 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>