More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6214 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  99.23 
 
 		 389 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 389 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  99.23 
 
 		 389 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  63.84 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  60.39 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 390 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  32.48 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 960 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 983 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 984 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  32.53 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  29.06 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.63 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.74 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.09 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 816 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.53 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 806 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.11 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.21 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.56 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  24.46 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.81 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.86 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>