More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5996 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  98.78 
 
 		 245 aa  483  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  98.78 
 
 		 245 aa  483  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  96.33 
 
 		 245 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  93.06 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  93.06 
 
 		 261 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  91.39 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.03 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.18 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  30.22 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  30.84 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  28.27 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  28.27 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  28.27 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  32.89 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  35.02 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  27.39 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  29.69 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.64 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  35 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  30.05 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  32.19 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.1 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  28.05 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  28.05 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  30.08 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  36.02 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  31.38 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  30.08 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.05 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  30.08 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.41 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  27.9 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.95 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.63 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  29.96 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  29.96 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  29.96 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  29.78 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.41 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.96 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  34.39 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  27.78 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  31.86 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.23 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.78 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  29.08 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.75 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  30.87 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.19 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.49 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  30.38 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  26.55 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  27.31 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  33.5 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  27.31 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  28.19 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  29.07 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  27.31 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.31 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  28.69 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>