More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5932 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 		 357 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  46.76 
 
 		 352 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  46.76 
 
 		 352 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  45.85 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  44.48 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  44.67 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  45.17 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  45.17 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  45.17 
 
 		 352 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  44.11 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  44.48 
 
 		 420 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  44.48 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  43.41 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  43.41 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  43.41 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  43.28 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  35.14 
 
 		 346 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  36.54 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  35.91 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.65 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.98 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.93 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  33.15 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  34.36 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  35.56 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.96 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  34.83 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.62 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  34.17 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.56 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.11 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.53 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.77 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.62 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.83 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.03 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  32.04 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  32.04 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  31.77 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.39 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.48 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  34 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  31.49 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  32.6 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.2 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.68 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.88 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.88 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.91 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.87 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.48 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  31.3 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  36.86 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.14 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0043  type III secretion exporter  32.77 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0406  type III secretion exporter  33.43 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.715015  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.29 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.34 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.46 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  30 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.89 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.23 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.18 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.96 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.41 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.47 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.96 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.79 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.44 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.86 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.11 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.2 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.44 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.38 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  35.84 
 
 		 343 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  31.99 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.58 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.87 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.5 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00962  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06204  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>