More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5863 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
658 aa  1330    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.06 
 
 
852 aa  888    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.06 
 
 
666 aa  891    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  87.06 
 
 
655 aa  1145    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  58.39 
 
 
646 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  59.54 
 
 
627 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.01 
 
 
635 aa  1001    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.52 
 
 
663 aa  697    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.06 
 
 
666 aa  891    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  74.23 
 
 
917 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  57.23 
 
 
635 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.7 
 
 
714 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  92.69 
 
 
692 aa  1234    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.23 
 
 
635 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.7 
 
 
696 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.86 
 
 
662 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.22 
 
 
653 aa  880    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  70.97 
 
 
659 aa  878    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  97.57 
 
 
658 aa  1278    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.06 
 
 
666 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.06 
 
 
666 aa  891    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.23 
 
 
666 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.61 
 
 
655 aa  1138    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.52 
 
 
663 aa  697    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  97.57 
 
 
658 aa  1278    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.93 
 
 
647 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  86.15 
 
 
676 aa  1138    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 
697 aa  601  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  52.26 
 
 
694 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.89 
 
 
687 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.14 
 
 
607 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.72 
 
 
697 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  50.73 
 
 
706 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
699 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
686 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  50.25 
 
 
699 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
694 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  50.33 
 
 
630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.43 
 
 
610 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.87 
 
 
706 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 
630 aa  570  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.07 
 
 
639 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.95 
 
 
705 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
646 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
646 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  51.34 
 
 
615 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
625 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  51.63 
 
 
702 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.12 
 
 
624 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  54.75 
 
 
623 aa  565  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 
610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  51.99 
 
 
645 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  48.58 
 
 
627 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.11 
 
 
635 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  49.43 
 
 
605 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
623 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
605 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 
645 aa  555  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.79 
 
 
618 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
633 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
615 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.94 
 
 
645 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
617 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.56 
 
 
612 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.42 
 
 
714 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  50.24 
 
 
616 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 
637 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
623 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  50.84 
 
 
618 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
612 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48 
 
 
640 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.38 
 
 
641 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.08 
 
 
717 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.4 
 
 
713 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.76 
 
 
614 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 
636 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 
616 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  50.76 
 
 
617 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  52.32 
 
 
637 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.38 
 
 
610 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  50.17 
 
 
629 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.02 
 
 
618 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.4 
 
 
652 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 
647 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.45 
 
 
653 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 
673 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.15 
 
 
665 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.02 
 
 
618 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 
611 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 
602 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  50.85 
 
 
621 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.21 
 
 
610 aa  534  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.19 
 
 
673 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  54 
 
 
691 aa  533  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.09 
 
 
652 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.71 
 
 
648 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.61 
 
 
630 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  47.34 
 
 
641 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 
607 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>