126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5837 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  276  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  93.38 
 
 		 136 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  91.91 
 
 		 136 aa  256  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  94.34 
 
 		 117 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  55.56 
 
 		 163 aa  156  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  46.76 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  46.76 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  46.76 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  43.8 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  43.07 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  44.93 
 
 		 139 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  42.65 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  42.65 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  44.12 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  42.34 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  43.17 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  42.86 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  43.38 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  42.34 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  41.18 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  43.38 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  43.38 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  41.3 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  39.26 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  42.22 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  39.13 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  44.37 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  40.44 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  36.88 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  35.97 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  37.41 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  34.72 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  36.17 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  34.75 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  35.56 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  35.66 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  35.46 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  28.37 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  34.04 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  35.46 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0576  PilT protein-like  34.78 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  34.53 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  35.92 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  34.75 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3379  PilT domain-containing protein  35.97 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  31.21 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  30.5 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  31.21 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  31.69 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  35.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  34.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  30.83 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0141  PilT protein-like  40.57 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  33.8 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  32.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  33.57 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  34.45 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  30.5 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  32.87 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  31.47 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.8 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  32.86 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  28.97 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  29.86 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  29.86 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  46.3 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  31.29 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  28.17 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  28.47 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  27.86 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>