More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5809 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  97.26 
 
 
477 aa  940  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
477 aa  965  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  79.96 
 
 
491 aa  775  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  79.96 
 
 
493 aa  775  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  71.19 
 
 
471 aa  702  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  92.66 
 
 
477 aa  907  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
477 aa  965  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 
491 aa  772  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  72.46 
 
 
471 aa  704  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  100 
 
 
477 aa  967  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  79.96 
 
 
493 aa  775  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  88.2 
 
 
483 aa  852  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  92.45 
 
 
477 aa  904  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  79.96 
 
 
493 aa  775  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  75.58 
 
 
473 aa  734  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  79.96 
 
 
493 aa  775  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  79.07 
 
 
494 aa  769  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  59.62 
 
 
471 aa  572  1e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  59.62 
 
 
500 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  60.34 
 
 
481 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  57.78 
 
 
487 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  58 
 
 
469 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  58.89 
 
 
482 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  59.24 
 
 
473 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  57.02 
 
 
491 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.57 
 
 
484 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  57.14 
 
 
469 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
477 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
469 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.12 
 
 
483 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  56.41 
 
 
469 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  56.69 
 
 
483 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  54.68 
 
 
472 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  54.51 
 
 
489 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  55.16 
 
 
478 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  55.16 
 
 
478 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
470 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  54.43 
 
 
478 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
473 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
470 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  54.01 
 
 
479 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
476 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  54.39 
 
 
481 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.28 
 
 
470 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.06 
 
 
473 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  49.15 
 
 
483 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
473 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.94 
 
 
483 aa  460  1e-128  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  49.79 
 
 
472 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  51.91 
 
 
482 aa  446  1e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.62 
 
 
472 aa  448  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.21 
 
 
468 aa  446  1e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  50.21 
 
 
468 aa  446  1e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
468 aa  446  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  50.21 
 
 
468 aa  446  1e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  50.21 
 
 
468 aa  446  1e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  50.43 
 
 
474 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  50.21 
 
 
468 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  5.83102e-14 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  50.43 
 
 
474 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  50.43 
 
 
474 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
470 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  52.54 
 
 
472 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  49.58 
 
 
468 aa  440  1e-122  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  6.34797e-11 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
468 aa  441  1e-122  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  50.43 
 
 
474 aa  441  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
472 aa  441  1e-122  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  50.43 
 
 
474 aa  441  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
470 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  48.48 
 
 
433 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
433 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.53 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
470 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  45.88 
 
 
475 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.65 
 
 
470 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
473 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  48.61 
 
 
488 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
475 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  46.95 
 
 
473 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
473 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
469 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  47.22 
 
 
470 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
479 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 
532 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  47.01 
 
 
470 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
479 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 
473 aa  416  1e-115  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  45.96 
 
 
478 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  45.78 
 
 
473 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
474 aa  417  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
473 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
478 aa  416  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  46.53 
 
 
493 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  46.4 
 
 
478 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  44.89 
 
 
478 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
472 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>