More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5761 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  74.05 
 
 
634 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  71.5 
 
 
599 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  75.36 
 
 
623 aa  841    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  80.14 
 
 
596 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  74.05 
 
 
634 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  75.36 
 
 
623 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  64.01 
 
 
584 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  74.05 
 
 
634 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  75.68 
 
 
590 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  94.62 
 
 
595 aa  1050    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  75.81 
 
 
618 aa  815    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  100 
 
 
595 aa  1174    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  78.2 
 
 
599 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  93.78 
 
 
595 aa  1056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  65 
 
 
637 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  99.66 
 
 
595 aa  1170    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  77.66 
 
 
605 aa  849    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  70.98 
 
 
605 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  70.8 
 
 
605 aa  740    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  93.95 
 
 
595 aa  1056    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  69.62 
 
 
595 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  99.66 
 
 
595 aa  1170    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  74.05 
 
 
634 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  90.92 
 
 
595 aa  1030    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  50.35 
 
 
604 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  49.83 
 
 
606 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  50.35 
 
 
603 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  49.22 
 
 
600 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  50.86 
 
 
605 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  50.61 
 
 
593 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  51.19 
 
 
603 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  48.28 
 
 
633 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  48.98 
 
 
590 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  43.25 
 
 
613 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  51.8 
 
 
634 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  48.19 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.89 
 
 
577 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  36.43 
 
 
629 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  31.17 
 
 
593 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.3 
 
 
590 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  28.79 
 
 
608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.98 
 
 
587 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.82 
 
 
669 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.67 
 
 
582 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.62 
 
 
615 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.7 
 
 
598 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.59 
 
 
600 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  36.21 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.05 
 
 
584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.14 
 
 
597 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.25 
 
 
614 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  34.2 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.34 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  27.37 
 
 
613 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  31.52 
 
 
461 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  31.52 
 
 
461 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.92 
 
 
598 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.89 
 
 
754 aa  143  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.72 
 
 
402 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  30.23 
 
 
475 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.88 
 
 
606 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.16 
 
 
591 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.74 
 
 
580 aa  137  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  26.28 
 
 
569 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.82 
 
 
598 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.64 
 
 
631 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  32.36 
 
 
615 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  32.36 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.43 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 
593 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.84 
 
 
627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6569  Cl- channel, voltage gated  36.19 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.458011  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.02 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.77 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.42 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.33 
 
 
863 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.42 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.75 
 
 
426 aa  131  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.22 
 
 
589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.1 
 
 
862 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.31 
 
 
589 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26.54 
 
 
859 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.13 
 
 
628 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.61 
 
 
575 aa  127  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.38 
 
 
602 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  24.35 
 
 
579 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.38 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.38 
 
 
636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  28.6 
 
 
627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.9 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.38 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.38 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.12 
 
 
560 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.88 
 
 
612 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  27.36 
 
 
562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  24.67 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  29.67 
 
 
582 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.7 
 
 
617 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.83 
 
 
620 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>