283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5734 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  90.07 
 
 		 151 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 151 aa  256  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  80.27 
 
 		 147 aa  233  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.88 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.76 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  42.61 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.59 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.94 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.17 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>