More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5676 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  99.49 
 
 
389 aa  788    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  100 
 
 
389 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  99.49 
 
 
389 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  59.21 
 
 
384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  59.57 
 
 
391 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  57.03 
 
 
386 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  58.65 
 
 
382 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  58.65 
 
 
382 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  56.44 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  51.16 
 
 
380 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.16 
 
 
381 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.19 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.92 
 
 
414 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.8 
 
 
383 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.7 
 
 
384 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.17 
 
 
385 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.15 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.15 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.15 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.45 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.15 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.88 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.21 
 
 
383 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.97 
 
 
384 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.8 
 
 
394 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  45.21 
 
 
382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.92 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.54 
 
 
386 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  44.78 
 
 
394 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.2 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.41 
 
 
375 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.65 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.65 
 
 
376 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.55 
 
 
375 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  43.46 
 
 
381 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.29 
 
 
375 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.29 
 
 
375 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  42.9 
 
 
383 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.19 
 
 
383 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.97 
 
 
381 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  42.49 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.97 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.42 
 
 
381 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.01 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  44.06 
 
 
384 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.86 
 
 
383 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  40.29 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.88 
 
 
374 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.6 
 
 
383 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.97 
 
 
375 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  42.16 
 
 
403 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.05 
 
 
391 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.34 
 
 
390 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.67 
 
 
391 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.37 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.16 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.42 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.16 
 
 
379 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  41.41 
 
 
409 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.16 
 
 
379 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.16 
 
 
379 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.31 
 
 
383 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  42.38 
 
 
383 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  42.38 
 
 
383 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  41.41 
 
 
409 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  43.04 
 
 
380 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.12 
 
 
383 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.01 
 
 
379 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.2 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.46 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.77 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.94 
 
 
385 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  40.37 
 
 
385 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  41.75 
 
 
383 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  40.39 
 
 
418 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  41.62 
 
 
403 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  41.62 
 
 
398 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.39 
 
 
377 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  41.62 
 
 
403 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.09 
 
 
383 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.81 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.93 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.52 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  41.21 
 
 
471 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  40.39 
 
 
418 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.26 
 
 
380 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.41 
 
 
380 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  40.9 
 
 
383 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.26 
 
 
379 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.05 
 
 
389 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39.16 
 
 
384 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  41.9 
 
 
419 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  41.95 
 
 
386 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>