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for query gene Bcenmc03_5634 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.12 
 
 
504 aa  739  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.96 
 
 
505 aa  657  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99723e-07 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.26 
 
 
504 aa  848  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.43 
 
 
504 aa  910  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
504 aa  982  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.92 
 
 
519 aa  738  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.07 
 
 
509 aa  840  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.31 
 
 
504 aa  756  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.81 
 
 
509 aa  971  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.82 
 
 
513 aa  680  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.25 
 
 
509 aa  860  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.12 
 
 
504 aa  739  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.81 
 
 
509 aa  971  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.92 
 
 
504 aa  737  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.12 
 
 
504 aa  738  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.72 
 
 
504 aa  734  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.92 
 
 
504 aa  737  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  73.39 
 
 
520 aa  688  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  1.16602e-09 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.17 
 
 
504 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.76 
 
 
504 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.94 
 
 
501 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.8 
 
 
666 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 
680 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.39 
 
 
558 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  51.12 
 
 
666 aa  441  1e-122  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.59 
 
 
672 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.62 
 
 
569 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.54 
 
 
554 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 
522 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.44 
 
 
682 aa  417  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.29 
 
 
676 aa  417  1e-115  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.44 
 
 
682 aa  417  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.44 
 
 
682 aa  417  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.23 
 
 
528 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.62 
 
 
650 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.29 
 
 
685 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  46.46 
 
 
535 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.97 
 
 
539 aa  407  1e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.36 
 
 
525 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.7 
 
 
528 aa  399  1e-110  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.25 
 
 
685 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.27 
 
 
678 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.6 
 
 
535 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.62 
 
 
523 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.02 
 
 
697 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0922  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  50.4 
 
 
487 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1041  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 
487 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38776e-05 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.35 
 
 
567 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44425e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.24 
 
 
538 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.48 
 
 
530 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.15 
 
 
525 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.6 
 
 
516 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 
526 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 
538 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 
539 aa  358  1e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
541 aa  357  2e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 
523 aa  356  4e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.15 
 
 
514 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.97 
 
 
532 aa  353  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  39.33 
 
 
537 aa  345  7e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  4.10629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  42.94 
 
 
687 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.52 
 
 
565 aa  340  3e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  3.31464e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 
641 aa  338  1e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
537 aa  337  3e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  36.17 
 
 
537 aa  337  4e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  36.17 
 
 
537 aa  337  4e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  36.17 
 
 
537 aa  337  4e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  36.17 
 
 
537 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.49033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 
537 aa  336  6e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.04 
 
 
524 aa  336  7e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.33 
 
 
592 aa  336  7e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  35.78 
 
 
537 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.52569e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  35.78 
 
 
537 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.31 
 
 
1062 aa  334  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 
538 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.22683e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 
557 aa  329  5e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.96 
 
 
593 aa  327  2e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.3 
 
 
562 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.89 
 
 
575 aa  327  4e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
538 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  38.84 
 
 
476 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.29 
 
 
519 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.78 
 
 
607 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
584 aa  323  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.81 
 
 
555 aa  323  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.55 
 
 
685 aa  322  9e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 
528 aa  316  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
512 aa  315  1e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 
513 aa  313  4e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.16 
 
 
534 aa  313  5e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
491 aa  313  6e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.12 
 
 
513 aa  313  6e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07671e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
572 aa  312  7e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 
511 aa  313  7e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 
513 aa  312  8e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.81 
 
 
621 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.4 
 
 
513 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.14385e-07  normal 
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 
513 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.0213e-06  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 
513 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.09346e-08  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.08 
 
 
513 aa  310  3e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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